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• about() : CopasiUI3Window
• AboutDialog() : AboutDialog
• aboutQt() : CopasiUI3Window
• activateSlider() : BaseWidget , CQBarChart
• adaptToHeight() : CLabel
• add() : CNormalLcm , CFunctionParameters , CNormalLcm , CMoiety , CStateTemplate , CNormalSum , CCopasiContainer , CKeyFactory , CNormalSum , SBMLReference , IndexedTree , CNormalSum , CCopasiVector< CType > , CStepMatrix , CCopasiVectorN< CType > , CNormalCall , CFunctionDB , CXMLAttributeList , CFunctionParameters , CXMLAttributeList
• addAndAdaptName() : CFunctionDB
• addAssignment() : CProcessQueue
• addCalculation() : CProcessQueue
• addCallParameter() : CFunctionParameterMap
• addChannel() : CPlotItem
• addChild() : CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeVector , IndexedNode , CCopasiNode< _Data >
• addColumn() : CStepMatrix
• addCompartmentGlyph() : CLayout
• addCompartments() : CModelAdd
• addCompartmentsExpressions() : CModelAdd
• addCurve2D() : PlotSubwidget
• addCurveSegment() : CLCurve
• addCurveSlot() : PlotSubwidget
• addCurveTab() : PlotSubwidget
• addDatamodel() : CCopasiRootContainer
• addDefaultReports() : CCopasiDataModel
• addDefaultTasks() : CCopasiDataModel
• addDependent() : CDependencyGraphNode , CDependencyGraph
• addDeprecatedURL() : CMIRIAMResource
• addDirectDependency() : CCopasiObject
• addEdge() : CRDFNode
• addElementReference() : CArrayAnnotation
• addEvents() : CModelAdd
• addExperiment() : CExperimentSet , CFitItem
• addFile() : CRecentFiles
• addFix() : CKeyFactory
• addGraphicalObject() : CLayout
• addGroup() : CCopasiParameterGroup
• addHeaderToGrid() : TaskWidget
• addHisto1D() : PlotSubwidget
• addHisto1DTab() : PlotSubwidget
• addHistoSlot() : PlotSubwidget
• addHLineToGrid() : TaskWidget
• addInterface() : COutputHandler
• addItem() : CProgressBar , CProcessReport
• addItemInAnimation() : CQLayoutMainWindow
• addLayout() : CListOfLayouts
• addLine() : CTableauMatrix
• addMatrixReference() : CCopasiContainer
• addMetabolite() : CChemEq , CCompartment
• addMetaboliteGlyph() : CLayout
• addMetabolites() : CModelAdd
• addMetabolitesExpressions() : CModelAdd
• addMetabReferenceGlyph() : CLReactionGlyph
• addMethodParameterTable() : TaskWidget
• addMethodSelectionBox() : TaskWidget
• addMIRIAMResource() : CMIRIAMResources
• addModelValues() : CModelAdd
• addModelValuesExpressions() : CModelAdd
• addModifier() : CChemEqInterface , CReaction
• addNameSpace() : CRDFGraph
• addObjectReference() : CCopasiContainer
• addOptItem() : COptProblem
• addParameter() : CCopasiParameterGroup
• addParameterMapping() : CReaction
• addPlot() : PlotSubwidget
• addProduct() : CReaction
• addReactionGlyph() : CLayout
• addReactions() : CModelAdd
• addReport() : CCopasiDataModel
• addSlider() : SliderDialog
• addSubstrate() : CReaction
• addTask() : CCopasiDataModel
• addTextGlyph() : CLayout
• addToMultiplicity() : CChemEqElement
• addTriplet() : CRDFGraph
• addTripletToGraph() : CRDFNode
• addVariable() : CFunction
• addVariables() : CSensProblem
• addVectorReference() : CCopasiContainer
• addWidget() : CScanContainerWidget
• adjustForEmptyLines() : CExperimentFileInfo
• adjustTable() : TaskWidget
• allocate() : CTimeSeries
• allPositive() : CSteadyStateMethod
• append() : CReport
• appendDependentCompartments() : CModel
• appendDependentEvents() : CModel
• appendDependentFunctions() : CFunctionDB
• appendDependentMetabolites() : CModel
• appendDependentModelObjects() : CModel
• appendDependentModelValues() : CModel
• appendDependentReactions() : CModel
• appendDependentTasks() : CCopasiDataModel
• appendElementReferences() : CArrayAnnotation
• applyDelayRefreshes() : CMathEvent
• applyDependentRefreshes() : CMathEvent
• applyExponent() : CUnit
• applyInitialValues() : CModel , CMathModel
• applyInverseExponent() : CUnit
• applyPivot() : CVector< CType > , CMatrix< CType >
• applyStoichiometricExpressions() : SBMLImporter
• applyValueRefreshes() : CMathEvent
• areApproximatelyEqual() : SBMLImporter
• areEqual() : CNormalBase , UnitConversionFactory
• areEqualFunctions() : SBMLImporter
• areEqualSubtrees() : SBMLImporter
• areEquivalent() : UnitConversionFactory
• areRulesUnique() : SBMLImporter
• areSBMLUnitDefinitionsIdentical() : SBMLImporter
• array() : CArrayAnnotation , CVectorCore< CType > , CMatrix< CType > , CVectorCore< CType > , CMatrix< CType >
• ArrayOf_USCORExsd_USCOREstring() : ArrayOf_USCORExsd_USCOREstring
• assembleSubTreeForMassAction() : CODEExporter
• assertGroup() : CCopasiParameterGroup
• assertParameter() : CCopasiParameterGroup
• assignSBMLIdsToReactions() : CSBMLExporter
• assistantBtnClicked() : TaskWidget
• attachKey() : ObjectBrowserItem
• attachNode() : CCopasiTree< _Node >
• autoexcept() : copasi::autoexcept
• autoSave() : CopasiUI3Window , CCopasiDataModel
• autoscale() : ValueScale
• autoUpdateMIRIAMResources() : CMIRIAMResources
• averageDivergence() : CLyapTask