Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- g -
- g
: CRandom::PoissonVars
- GCD()
: CBitPatternMethod
, CBitPatternTreeMethod
- GE
: CNormalLogicalItem
, CEvaluationNodeLogical
- GENERAL
: CFunctionAnalyzer
- generalize()
: CFunctionAnalyzer::CValue
- generateCanonicalDNF()
: CNormalLogical
- generatedNodeId()
: CRDFGraph
- GenerateIdHandler()
: CRDFParser
- generateReactionIndex()
: CStochMethod
- generateReactionTime()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
, CStochMethod
- GeneticAlgorithm
: CCopasiMethod
- GeneticAlgorithmSR
: CCopasiMethod
- genrand_res53()
: Cmt19937
- get()
: CKeyFactory
- get_autothrow_id()
: copasi::autoexcept
- get_help_comment()
: copasi::option_error
- get_locations()
: copasi::COptionParser
- get_non_options()
: copasi::COptionParser
- get_options()
: copasi::COptionParser
- getAboutNode()
: CRDFGraph
- getActivity()
: CPlotItem
, C2DPlotCurve
- getAdjustInitialConditions()
: CScanProblem
- getAffects()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
- getAllDependencies()
: CCopasiObject
- getAllMessageText()
: CCopasiMessage
- getAllowedLocationList()
: CRDFPredicate
- getAllUnsetBitIndexes()
: CStepMatrix
, CStepMatrixColumn
- getAmplitudeAnn()
: CCSPMethod
- getAndSets()
: CNormalLogical
- getAnimationRunning()
: CQLayoutMainWindow
- getAnnotationsCN()
: CArrayAnnotation
- getAnnotationsString()
: CArrayAnnotation
- getApplicationFont()
: CConfigurationFile
- getApplyInitialValueRefresh()
: CConcentrationReference
- getAreaUnitEnum()
: CModel
- getAreaUnitName()
: CModel
- getArrow()
: CGraphCurve
- getArrowLength()
: CArrow
- getArrowWidth()
: CArrow
- getAssignments()
: CEvent
- getAssociatedEntityKey()
: CSlider
- getAttribute()
: CXMLAttributeList
- getAttributeValue()
: CExpatTemplate< CType >
- getAvogadro()
: CModel
- getBackwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getBalances()
: CChemEq
- getBase1()
: CLLineSegment
- getBase2()
: CLLineSegment
- getBiologicalDescriptions()
: CMIRIAMInfo
- getBlankNodeID()
: CRDFObject
, CRDFSubject
- getBlankNodeMap()
: CRDFGraph
- getBodyAddr()
: CReportDefinition
- getBoundingBox()
: CLGraphicalObject
- getBuffer()
: CExpatTemplate< CType >
- getCalculateValue()
: COptProblem
- getCalculateVariableUpdateMethods()
: COptProblem
- getCallBack()
: CCopasiTask
- getCalledTree()
: CEvaluationNodeCall
- getCells()
: CTableRow
- getChannels()
: CPlotItem
- getCharacterData()
: CCopasiXMLParser
- getChemEq()
: CReaction
- getChemEqInterface()
: CReactionInterface
- getChemEqString()
: CChemEqInterface
, CReactionInterface
- getChild()
: CCopasiNode< _Data >
- getChildObjectUnits()
: CCompartment
, CMetab
, CModel
, CReaction
, CCopasiContainer
- getChildrenCount()
: CBitPatternTreeNode
- getChoices()
: CNormalLogical
- getCN()
: CArrayElementReference
, CCopasiObject
, CQReportListItem
- getCollapsedResult()
: CSensProblem
- getCollapsedResultAnnotated()
: CSensProblem
- getColor()
: CColorScale
, CColorScale1
, CColorScaleSimple
, CColorScaleAdvanced
, CColorScaleBiLog
- getColorCoding()
: CQArrayAnnotationsWidget
- getColSliderPos()
: Plot3d
- getColumnIndex()
: CCompressedColumnFormat::const_row_iterator
- getColumnNames()
: CExperiment
- getColumns()
: CSparseMatrix
- getColumnStart()
: CCompressedColumnFormat
- getComment()
: CReportDefinition
- getCompartment()
: CChemEqInterface
, CMetab
- getCompartmentNumber()
: CChemEq
, CReaction
- getCompartments()
: CModel
- getConcentration()
: CMetab
- getConcentrationData()
: CTimeSeries
- getConcentrationRate()
: CMetab
- getConcentrationRateUnitsDisplayString()
: CModel
- getConcentrationReference()
: CMetab
- getConcentrationUnitsDisplayString()
: CModel
- getCondition()
: CNormalChoiceLogical
, CNormalChoice
, CNormalChoiceLogical
- getConfiguration()
: CCopasiRootContainer
- getConstant()
: CNodeK
- getConstraintList()
: COptProblem
- getConstraintViolation()
: COptItem
, CFitItem
, CFitConstraint
- getCOPASI2SBMLMap()
: CSBMLExporter
- getCopasi2SBMLMap()
: CCopasiDataModel
- getCOPASIkey()
: SBMLReference
- getCorrelations()
: CFitProblem
- getCount()
: CExperiment
- getCPUTime()
: CCopasiTimeVariable
- getCreatedDT()
: CMIRIAMInfo
- getCreators()
: CMIRIAMInfo
- getCrossingsLimit()
: CCrossSectionProblem
- getCSlider()
: CopasiSlider
- getCSlidersForCurrentFolderId()
: SliderDialog
- getCSlidersForObject()
: SliderDialog
- getCurrentByteCount()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentByteIndex()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentColumnNumber()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentGroup()
: CCopasiXMLParser
- getCurrentItemId()
: ListViews
- getCurrentLineNumber()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentObjectList()
: SensWidgetComboBox
- getCurrentPositionX()
: CQGLNetworkPainter
- getCurrentPositionY()
: CQGLNetworkPainter
- getCurrentSBMLDocument()
: CCopasiDataModel
- getCurrentStep()
: CQLayoutMainWindow
- getCurrentWallTime()
: CCopasiTimeVariable
- getCurrentWidget()
: ListViews
- getCurve()
: CLMetabReferenceGlyph
, CLReactionGlyph
- getCurveSegments()
: CLCurve
- getData()
: CEvaluationNodeObject
, CTimeSeries
, CCopasiNode< _Data >
, CCopasiTree< _Node >
- getDataModel()
: CopasiUI3Window
, CopasiWidget
, ListViews
- getDatamodelList()
: CCopasiRootContainer
- getDataPointCount()
: CExperimentSet
- getDataResources()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataSetAt()
: CQGLNetworkPainter
- getDataType()
: CRDFLiteral
- getDataTypeDef()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypePattern()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypesId()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypesIdReturn
: ns2__getDataTypesIdResponse
- getDataTypesName()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypesNameReturn
: ns2__getDataTypesNameResponse
- getDataTypeSynonyms()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypeURI()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypeURIs()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDate()
: CModification
- getDays()
: CCopasiTimeVariable
- getDebugString()
: CDimension
- getDefaultAtol()
: CHybridMethodLSODA
- getDefaultMode()
: CArrayAnnotation
- getDefaultPlotIndex()
: COutputAssistant
- getDefaultReportIndex()
: COutputAssistant
- getDefaults()
: CReadConfig
- getDefaultWeight()
: CExperiment
, CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
- getDelayAssignment()
: CEvent
- getDelayExpression()
: CEvent
- getDelayExpressionPtr()
: CEvent
- getDeletedObjects()
: CEvaluationTree
, CCompartment
, CMetab
, CModelEntity
, CReaction
- getDeletedParameters()
: CReactionInterface
- getDenominator()
: CNormalFraction
, CNormalProduct
- getDependentData()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getDependentErrorMean()
: CExperimentSet
- getDependentErrorMeanSD()
: CExperimentSet
- getDependentNumber()
: CMoiety
- getDependentObjectiveValues()
: CExperimentSet
- getDependentObjects()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getDependentRMS()
: CExperimentSet
- getDependents()
: CDependencyGraphNode
, CDependencyGraph
- getDependsOn()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
- getDescendantsWithPredicate()
: CRDFNode
- getDescription()
: CReference
, CMoiety
, CArrayAnnotation
, CCopasiTask
- getDetails()
: SBMLIncompatibility
- getDimensionality()
: CCompartment
- getDimensionDescription()
: CArrayAnnotation
- getDimensions()
: CLayout
, CLBoundingBox
, CLGraphicalObject
, CFindDimensions
- getDirectDependencies()
: CConcentrationReference
, CParticleReference
, CCopasiObject
- getDisplay_C_String()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeConstant
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
- getDisplay_MMD_String()
: CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
, CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeConstant
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
- getDisplay_XPP_String()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeConstant
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
- getDisplayExpressionString()
: CODEExporter
, CODEExporterBM
, CODEExporterC
, CODEExporterXPPAUT
- getDisplayFunctionString()
: CODEExporter
, CODEExporterBM
, CODEExporterXPPAUT
- getDisplayName()
: CMIRIAMResourceObject
, CRDFPredicate
, CMetabNameInterface
- getDisplayString()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
, CUnit
, CUnitInformation
, CDimension
- getDuration()
: CTrajectoryProblem
, CTSSAProblem
- getEigenValues()
: CSteadyStateTask
- getEigenValuesReduced()
: CSteadyStateTask
- getElapsedTime()
: CCopasiTimer
- getElementIndex()
: CCopasiObjectName
- getElementName()
: CCopasiObjectName
- getEmail()
: CCreator
- getEnd()
: CLLineSegment
- getEndOfLine()
: CArrow
- getEndValue()
: CProcessReportItem
- getEntities()
: CStateTemplate
- getEnvironmentVariable()
: COptions
- getErrorCode()
: CExpatTemplate< CType >
- getErrorMean()
: CExperiment
- getErrorMeanSD()
: CExperiment
- getErrorPosition()
: yyYaccParser
, CEvaluationTree
- getErrorString()
: CExpatTemplate< CType >
- getEvents()
: CModel
- getExecutionTime()
: CMathEvent
, COptProblem
- getExp()
: CNormalItemPower
- getExpatVersion()
: CExpatTemplate< CType >
- getExperiementSet()
: CFitProblem
- getExperiment()
: CExperimentFileInfo
, CExperimentSet
, CFitItem
- getExperimentCount()
: CExperimentSet
, CFitItem
- getExperimentNames()
: CExperimentFileInfo
- getExperiments()
: CFitItem
- getExperimentType()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getExplicitFunctionString()
: CNodeK
- getExponentNumber()
: CLyapProblem
- getExpression()
: CEventAssignment
, CModelEntity
, CMoiety
, CQValidatorExpression
, CQExpressionWidget
- getExpressionPtr()
: CEventAssignment
, CModelEntity
- getExpressions()
: CUnitInterfaceSBML
- getExpressionTree()
: CReaction
- getFactor()
: CNormalProduct
- getFalseExpression()
: CNormalChoice
, CNormalChoiceLogical
- getFamilyName()
: CCreator
- getFastReactionPointerAnn()
: CCSPMethod
- getFastReactionPointerNormedAnn()
: CCSPMethod
- getFieldCopasiObject()
: ObjectBrowserWidget
- getFieldValue()
: CRDFNode
- getFilename()
: CFunctionDB
- getFileName()
: CCopasiDataModel
, CExperiment
, CExperimentFileInfo
- getFileNames()
: CExperimentSet
- getFirstMessage()
: CCopasiMessage
- getFirstRow()
: CExperiment
- getFirstUnconvertedRow()
: CStepMatrix
- getFirstUnusedSection()
: CExperimentFileInfo
- getFisherInformation()
: CFitProblem
- getFittingPoints()
: CExperiment
- getFlagLimitCrossings()
: CCrossSectionProblem
- getFlagLimitTime()
: CCrossSectionProblem
- getFlux()
: CReaction
- getFluxMode()
: CTableauLine
- getFluxModeDescription()
: CEFMTask
- getFluxModes()
: CEFMProblem
, CEFMTask
- getFontSize()
: CQGLNetworkPainter
, CQLayoutMainWindow
- getFooterAddr()
: CReportDefinition
- getForwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getFraction()
: CNormalFunction
- getFractions()
: CNormalCall
, CNormalSum
- getFrequencyUnitsDisplayString()
: CModel
- getFunction()
: CReaction
, CReactionInterface
, CQValidatorFunction
, CQExpressionWidget
- getFunctionDefinitionForName()
: SBMLImporter
- getFunctionDescription()
: CReactionInterface
- getFunctionEvaluations()
: COptProblem
- getFunctionList()
: CCopasiRootContainer
, CCopasiXML
- getFunctionName()
: CReactionInterface
- getFunctionParameters()
: CFunctionParameterMap
, CReaction
- getGivenName()
: CCreator
- getGraphicalObject()
: CLTextGlyph
- getGraphicalObjectKey()
: CLTextGlyph
- getGraphMax()
: CQGLNetworkPainter
- getGraphMin()
: CQGLNetworkPainter
- getGroup()
: CCopasiParameterGroup
- getGUI()
: CCopasiDataModel
, CCopasiXML
- getHeaderAddr()
: CReportDefinition
- getHeaderRow()
: CExperiment
- getHeight()
: CLDimensions
, CLGraphicalObject
- getHierarchy()
: CEigen
- getHighestSeverity()
: CCopasiMessage
- getHours()
: CCopasiTimeVariable
- getI()
: CEigen
- getIcon()
: CQIcons
- getId()
: CBiologicalDescription
, CMIRIAMResourceObject
, CRDFNode
, CReference
, SBMLUtils
, DataModelGUI
, IndexedNode
- getIdFromSBase()
: SBMLUtils
- getIdsFromNode()
: SBMLImporter
- getIgnoreUpdates()
: CopasiWidget
- getImage()
: CQGLNetworkPainter
- getImportanceIndexAnn()
: CCSPMethod
- getImportanceIndexNormedRowAnn()
: CCSPMethod
- getImportCOPASIMIRIAM()
: SBMLImporter
- getImportHandlerAddr()
: SBMLImporter
- getIncomingTriplets()
: CRDFGraph
- getIncrement()
: C2DPlotCurve
- getIndependentData()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getIndex()
: CEvaluationNodeVariable
, CNodeK
, CMetabOld
, CStateTemplate
, CCopasiParameterGroup
, CCopasiVector< CType >
, CCopasiVectorN< CType >
- getInfix()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CEvaluationTree
- getInfo()
: CUnitInformation
- getInitialConcentration()
: CMetab
- getInitialConcentrationReference()
: CMetab
- getInitialExpression()
: CModelEntity
- getInitialExpressionPtr()
: CModelEntity
- getInitialState()
: CModel
- getInitialTime()
: CMathModel
, CModel
- getInitialValue()
: CModelEntity
- getInitialValueReference()
: CModelEntity
, CMoiety
- getInputContext()
: CExpatTemplate< CType >
- getInterfaces()
: COutputHandler
- getInternalSpecies()
: CEFMTask
- getItem()
: CNormalItemPower
, COutputAssistant
- getItemName()
: COutputAssistant
- getItemPowers()
: CNormalLcm
, CNormalProduct
- getItems()
: CPlotSpecification
- getItemToType()
: CQCompartmentDM
, CQGlobalQuantityDM
, CQSpecieDM
- getItemType()
: CNormalItemPower
- getJacobian()
: CSteadyStateTask
- getJacobianAnnotated()
: CSteadyStateTask
- getJacobianReduced()
: CSteadyStateTask
- getJacobianXAnnotated()
: CSteadyStateTask
- getJavaLibraryVersion()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getJavaLibraryVersionReturn
: ns2__getJavaLibraryVersionResponse
- getKey()
: CReportDefinition
, CReportDefinitionVector
, CTimeSeries
, DataModelGUI
, CCopasiParameter
, CCopasiParameterGroup
, CCopasiTask
, CIndexedPriorityQueue
, CSlider
, CEvaluationTree
, CFunctionParameter
, CLayout
, CLGraphicalObject
, CListOfLayouts
, CBiologicalDescription
, CCreator
, CMIRIAMInfo
, CModification
, CReference
, CEventAssignment
, CEvent
, CModel
, CModelEntity
, CMoiety
, CReaction
, COutputDefinitionVector
, CCopasiObject
- getKeyFactory()
: CCopasiRootContainer
- getKeyForRow()
: CQCurrentValueTable
- getKeySpace()
: ObjectBrowserItem
- getL()
: CModel
- getL0()
: CModel
- getLabelText()
: CGraphNode
- getLanguage()
: CRDFLiteral
- getLargestCompartment()
: CChemEq
, CReaction
- getLastColumn()
: CExperimentObjectMap
- getLastFilledCell()
: CTableRow
- getLastMessage()
: CCopasiMessage
- getLastNotIgnoredColumn()
: CExperimentObjectMap
- getLastRow()
: CExperiment
- getLayoutList()
: CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getLeft()
: CNormalGeneralPower
, CNormalLogicalItem
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeOperator
, CNodeK
- getLengthUnitEnum()
: CModel
- getLengthUnitName()
: CModel
- getLexicalData()
: CRDFLiteral
- getLicenseHTML()
: CCopasiRootContainer
- getLicenseTxt()
: CCopasiRootContainer
- getLine()
: CArrow
- getListOfChildNodes()
: CEvaluationNodeCall
- getListOfCompartmentGlyphs()
: CLayout
- getListOfConflictingNodes()
: CUnitInterfaceSBML
- getListOfConstantRefreshes()
: CModel
- getListOfConstObjects()
: CObjectLists
- getListOfContainer()
: CExpression
- getListOfDefaultOutputDescriptions()
: COutputAssistant
- getListOfDisplayNames()
: CChemEqInterface
- getListOfGraphicalObjects()
: CLayout
- getListOfInitialRefreshes()
: CModel
- getListOfLayouts()
: CCopasiDataModel
- getListOfLocalParametersWithGivenUnitStatus()
: CUnitInterfaceSBML
- getListOfMetaboliteGlyphs()
: CLayout
- getListOfMetabReferenceGlyphs()
: CLReactionGlyph
- getListOfMetabs()
: CReactionInterface
- getListOfMultiplicities()
: CChemEqInterface
- getListOfNonSimulatedRefreshes()
: CModel
- getListOfObjects()
: CObjectLists
- getListOfObjectsWithGivenUnitStatus()
: CUnitInterfaceSBML
- getListOfPoints()
: CLCurve
- getListOfPossibleFunctions()
: CReactionInterface
- getListOfReactionGlyphs()
: CLayout
- getListOfSimulatedRefreshes()
: CModel
- getListOfTextGlyphs()
: CLayout
- getListType()
: CSensItem
- getListTypeDisplayName()
: CSensItem
- getLiteral()
: CRDFObject
- getLocalResourceNodeMap()
: CRDFGraph
- getLocalValue()
: CReactionInterface
, CFitItem
- getLocation()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getLocations()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getLocations_()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getLowerBound()
: COptItem
- getLowerBoundValue()
: COptItem
- getMainThread()
: CopasiUI3Window
- getMainWidget()
: CopasiUI3Window
- getMappedObjects()
: CExperimentObjectMap
- getMappedUnitFromIdentifier()
: CUnitInterfaceSBML
- getMappedUnitFromNumberNode()
: CUnitInterfaceSBML
- getMapping()
: CReactionInterface
- getMappingMode()
: CQLayoutMainWindow
- getMappings()
: CReactionInterface
- getMathML()
: Expression2PresentationMMLUnits
- getMathTrigger()
: CMathEvent
- getMaxForSpecies()
: CSimSummaryInfo
- getMaximagpart()
: CEigen
- getMaxNodeSize()
: CQLayoutMainWindow
- getMaxOverallConcentration()
: CSimSummaryInfo
- getMaxrealpart()
: CEigen
- getMaxValue()
: CSlider
- getMCAWidget()
: ListViews
- getMessage()
: SBMLIncompatibility
, CCopasiException
- getMessageAboutUnknownUnits()
: CUnitInterfaceSBML
- getMetabGlyph()
: CLMetabReferenceGlyph
- getMetabGlyphKey()
: CLMetabReferenceGlyph
- getMetabolite()
: CChemEqElement
, CMetabNameInterface
- getMetaboliteKey()
: CChemEqElement
, CMetabNameInterface
- getMetabolitePermutation()
: CModel
- getMetabolites()
: CCompartment
, CModel
- getMetabolitesX()
: CModel
- getMethod()
: CCopasiTask
- getMethodLog()
: CSteadyStateMethod
- getMicroSeconds()
: CCopasiTimeVariable
- getMilliSeconds()
: CCopasiTimeVariable
- getMinForSpecies()
: CSimSummaryInfo
- getMinNodeSize()
: CQLayoutMainWindow
- getMinOverallConcentration()
: CSimSummaryInfo
- getMinutes()
: CCopasiTimeVariable
- getMinValue()
: CSlider
- getMiriamAnnotation()
: CAnnotation
- getMIRIAMCitation()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMDeprecated()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMDisplayName()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMInfo()
: CQMiriamWidget
- getMIRIAMLastUpdateDate()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMMIRIAMResource()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMPattern()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMResource()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMResourceIndex()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMResources()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMUpdateFrequency()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMURI()
: CMIRIAMResource
- getMiriamURI()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getMMLName()
: CMathMl
- getMode()
: CArrayAnnotation
- getModel()
: CCopasiDataModel
, CMetab
, CUnitInterfaceSBML
, CMCAMethod
, CCopasiProblem
, CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getModelObject()
: CLGraphicalObject
- getModelObjectDisplayName()
: CLGraphicalObject
- getModelObjectKey()
: CLGraphicalObject
- getModelObjectName()
: CLGraphicalObject
- getModelType()
: CModel
- getModelValues()
: CModel
- getModifications()
: CMIRIAMInfo
- getModifierCompartments()
: yyYaccParser
- getModifierMulitplicities()
: yyYaccParser
- getModifierNames()
: yyYaccParser
- getModifiers()
: CChemEq
- getModulus()
: CRandom
- getMoieties()
: CModel
- getMolecularity()
: CChemEq
, CChemEqInterface
- getMultiplicity()
: CChemEqElement
- getMultiplier()
: CFluxMode
, CStepMatrixColumn
, CTableauLine
- getName()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
, CTableCell
, CNormalCall
, CNormalItem
, CNodeK
, CExperimentObjectMap
, IndexedNode
, CCopasiParameterGroup
, CXMLAttributeList
- getNameForNodeKey()
: CQGLNetworkPainter
- getNames()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getNameSpaceMap()
: CRDFGraph
- getNameSpaceQualifier()
: CRDFUtilities
- getNcplxconj()
: CEigen
- getNetReaction()
: CEFMTask
- getNext()
: CCopasiNode< _Data >
- getNextNonChild()
: CCopasiNode< _Data >
- getNextUnusedSection()
: CExperimentFileInfo
- getNimag()
: CEigen
- getNnegreal()
: CEigen
- getNode()
: DataModelGUI
, CMIRIAMResourceObject
- getNodeList()
: yyYaccParser
, CEvaluationTree
- getNodeNameEntry()
: CQGLNetworkPainter
- getNodeObject()
: CExpression
- getNodes()
: CKinFunction
- getNonOptions()
: COptions
- getNotes()
: CAnnotation
- getNposreal()
: CEigen
- getNreal()
: CEigen
- getNumAssignmentMetabs()
: CModel
- getNumber()
: CCopasiMessage
, CMoiety
- getNumber2QuantityFactor()
: CModel
- getNumberOfBits()
: CZeroSet
- getNumberOfElements()
: CDataEntity
- getNumberOfNodeEntries()
: CQGLNetworkPainter
- getNumberOfParametersByUsage()
: CFunctionParameters
- getNumberOfReactants()
: CSimSummaryInfo
- getNumberOfScanItems()
: CScanProblem
- getNumberOfSetBits()
: CZeroSet
- getNumberOfSteps()
: CQGLNetworkPainter
, CSimSummaryInfo
- getNumberOfSubtaskCalculations()
: CSensMethod
- getNumberOfUnsetBits()
: CZeroSet
- getNumberOfVariables()
: CSensProblem
- getNumChannels()
: CPlotItem
- getNumColumns()
: CExperiment
- getNumCurveSegments()
: CLCurve
- getNumDataRows()
: CExperiment
- getNumDependent()
: CStateTemplate
, CState
- getNumDependentReactionMetabs()
: CModel
- getNumerator()
: CNormalFraction
- getNumFixed()
: CStateTemplate
, CState
- getNumIndependent()
: CStateTemplate
, CState
- getNumIndependentReactionMetabs()
: CModel
- getNumMetabs()
: CModel
- getNumModelValues()
: CModel
- getNumODEMetabs()
: CModel
- getNumRoots()
: CModel
, CMathModel
- getNumSteps()
: CScanItem
- getNumUnconvertedRows()
: CStepMatrix
- getNumVariable()
: CState
, CStateTemplate
- getNumVariableMetabs()
: CModel
- getNumVariables()
: CTimeSeries
- getNzero()
: CEigen
- getObject()
: CArrayAnnotation
, CCopasiMatrixReference< CType >
, Refresh
, CRDFNode
, COptItem
, CCopasiContainer
, RefreshTemplate< CClass >
, CCopasiObject
, CCopasiVectorReference< CType >
, CScanItem
, ObjectBrowserItem
, CParameterListItem
, CCopasiVector< CType >
, CCopasiVectorN< CType >
- getObjectAncestor()
: CCopasiObject
- getObjectCN()
: CEvaluationNodeObject
, COptItem
, CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
- getObjectDataFromRefresh()
: CDotOutput
- getObjectDataModel()
: CCopasiObject
- getObjectDisplayName()
: CMetab
, CCopasiObject
, CEvent
, CReaction
, COptItem
, CArrayElementReference
, CCopasiObjectReference< CType >
, CCopasiStaticString
, CCopasiReportSeparator
, CArrayAnnotation
, CCopasiParameter
- getObjectFromName()
: CCopasiXMLParser
- getObjectiveFunction()
: COptProblem
- getObjectiveValue()
: CExperiment
- getObjectKey()
: IndexedNode
, CCompartmentGraphNode
, CGraphNode
- getObjectMap()
: CExperiment
- getObjectName()
: CCopasiObject
, CCopasiObjectName
- getObjectParent()
: CCopasiObject
- getObjects()
: COutputInterface
, CFunctionParameterMap
, PlotWindow
, CCopasiContainer
, CopasiTableWidget
, CQLayoutsWidget
- getObjectSingle()
: CCopasiSelectionDialog
- getObjectType()
: CCopasiObject
, CCopasiObjectName
- getObjectValue()
: COptItem
, CFitItem
- getObjectVector()
: CCopasiSelectionDialog
- getOfficialDataTypeURI()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getOpenFileName()
: CopasiFileDialog
- getOptItem()
: COptProblem
- getOptItemList()
: COptProblem
- getOptItemSize()
: COptProblem
- getOrder()
: CEvent
, CMathEvent
- getORG()
: CCreator
- getOrigHeight()
: CLabel
- getOriginalValue()
: CSlider
- getOrigNodeKey()
: CCompartmentGraphNode
, CGraphNode
- getOrigValueForSpecies()
: CDataEntity
- getOrigWidth()
: CLabel
- getOutputHandler()
: CCopasiTask
- getOutputInSubtask()
: CScanProblem
- getOutputMode()
: CCopasiTask
- getOutputStartTime()
: CTrajectoryProblem
, CTSSAProblem
, CCrossSectionProblem
- getPainter()
: CQGLViewport
- getParameter()
: CCopasiParameterGroup
- getParameterByUsage()
: CFunctionParameters
- getParameterMapping()
: CReaction
- getParameterMappings()
: CReaction
- getParameterName()
: CReactionInterface
- getParameters()
: CReaction
- getParameterValue()
: CReaction
- getParent()
: CCopasiNode< _Data >
- getParentSubjects()
: CRDFGraph
- getParticipatesIn()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
- getParticipationIndexAnn()
: CCSPMethod
- getParticipationIndexNormedColumnAnn()
: CCSPMethod
- getParticipationIndexNormedRowAnn()
: CCSPMethod
- getParticleFlux()
: CModel
, CReaction
- getParticleFluxReference()
: CReaction
- getPath()
: CRDFNode
- getPauseAction()
: CQPlayerControlWidget
- getPlayAction()
: CQPlayerControlWidget
- getPlot()
: PlotWindow
- getPlotDefinitionList()
: DataModelGUI
, CCopasiDataModel
- getPlotList()
: CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getPoint()
: CArrow
- getPointers()
: CFunctionParameterMap
- getPosition()
: CLBoundingBox
, CLGraphicalObject
- getPossibleTargetFunctions()
: CSensProblem
- getPossibleVariables()
: CSensProblem
- getPrecision()
: CReportDefinition
- getPredicate()
: CBiologicalDescription
- getPredicateFromDisplayName()
: CRDFPredicate
- getPredicateFromURI()
: CRDFPredicate
- getPredicatePath()
: CRDFGraph
- getPrimary()
: CCopasiObjectName
- getProblem()
: CCopasiTask
- getProcessQueueExecutionTime()
: CMathModel
, CModel
, CProcessQueue
- getProductCompartments()
: yyYaccParser
- getProductMulitplicities()
: yyYaccParser
- getProductNames()
: yyYaccParser
- getProducts()
: CNormalSum
, CChemEq
- getptc_()
: CTruncatedNewton
- getPWD()
: COptions
- getQApp()
: DataModelGUI
- getQuantity2NumberFactor()
: CModel
- getQuantityRateUnitsDisplayString()
: CModel
- getQuantityUnitEnum()
: CModel
- getQuantityUnitName()
: CModel
- getQuantityUnitOldXMLName()
: CModel
- getR()
: CEigen
- getRadicalPointerAnn()
: CCSPMethod
- getRandomCC()
: Cmt19937
, Cmt19937HR
, Cr250
, CRandom
- getRandomCO()
: Cmt19937HR
, CRandom
, Cr250
, Cmt19937
- getRandomExp()
: CRandom
- getRandomNormal()
: CRandom
- getRandomNormal01()
: CRandom
- getRandomNormalLog()
: CRandom
- getRandomNormalPositive()
: CRandom
- getRandomOO()
: Cmt19937HR
, Cmt19937
, CRandom
, Cr250
- getRandomPoisson()
: CRandom
- getRandomS()
: CRandom
, Cmt19937
, Cr250
- getRandomU()
: Cr250
, CRandom
, Cmt19937
, CRandom
- getRandomValue()
: COptItem
- getRate()
: CModelEntity
- getRateReference()
: CModelEntity
- getRDFGraph()
: CMIRIAMInfo
- getReacSlowSpacePrintAnn()
: CILDMMethod
- getReaction()
: CStepMatrixColumn
- getReactionEquation()
: CEFMTask
- getReactionName()
: CReactionInterface
- getReactions()
: CModel
- getRecentFiles()
: CConfigurationFile
- getRecentMIRIAMResources()
: CConfigurationFile
- getRecentSBMLFiles()
: CConfigurationFile
- getRecordedSteps()
: CTimeSeries
- getRedStoi()
: CModel
- getReferences()
: CMIRIAMInfo
- getRefresh()
: CCopasiObject
- getRemainder()
: CCopasiObjectName
- getRemoteResourceNodes()
: CRDFGraph
- getReorderedReactions()
: CEFMProblem
- getReport()
: CCopasiTask
- getReportDefinition()
: CReport
- getReportDefinitionList()
: CCopasiDataModel
- getReportList()
: CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getResiduals()
: CFitProblem
- getResource()
: CRDFObject
, CReference
, CBiologicalDescription
, CMIRIAMResourceObject
, CRDFSubject
- getResourceIndexFromDisplayName()
: CMIRIAMResources
- getResourceInfo()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getResourceInstitution()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getResourceList()
: CMIRIAMResourceObject
, CMIRIAMResources
- getResourceLocation()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getResult()
: CSteadyStateTask
, CSensProblem
, CFunctionAnalyzer
, CCopasiTask
- getResultAnnotated()
: CSensProblem
- getReversibility()
: CChemEq
, CChemEqInterface
- getRight()
: CNormalGeneralPower
, CNormalLogicalItem
, CNodeK
, CNormalGeneralPower
, CEvaluationNodeOperator
, CNormalLogicalItem
, CEvaluationNodeOperator
- getRMS()
: CFitProblem
, CExperiment
- getRole()
: CLMetabReferenceGlyph
, CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
, CGraphCurve
- getRoleDisplayName()
: CLMetabReferenceGlyph
- getRoot()
: CEvaluationTree
, CCopasiRootContainer
, CCopasiTree< _Node >
, CEvaluationTree
, CBitPatternTree
, ObjectList
, IndexedTree
- getRootFinders()
: CMathTrigger
, CModel
, CMathModel
- getRootNode()
: yyYaccParser
, DataModelGUI
- getRoots()
: CTrajectoryMethod
- getRootValuePtr()
: CMathTrigger::CRootFinder
- getRowIndex()
: CCompressedColumnFormat
- getRows()
: CSparseMatrix
- getRowSliderPos()
: Plot3d
- getSaveFileName()
: CopasiFileDialog
, CQSBMLFileDialog
- getSBMLBoundingBox()
: CLBoundingBox
- getSBMLDimensions()
: CLDimensions
- getSBMLDocument()
: CSBMLExporter
- getSBMLFileName()
: CCopasiDataModel
- getSBMLid()
: SBMLReference
- getSBMLId()
: CEvaluationTree
, CEvent
, CReaction
, CModelEntity
, CTimeSeries
- getSBMLLevel()
: UnitConversionFactory
- getSBMLPoint()
: CLPoint
- getSBMLUnitDefinition()
: CUnit
- getSBMLUnitDefinitionForId()
: SBMLImporter
- getSBMLVersion()
: UnitConversionFactory
- getScaledConcentrationCC()
: CMCAMethod
- getScaledConcentrationCCAnn()
: CMCAMethod
- getScaledElasticities()
: CMCAMethod
- getScaledElasticitiesAnn()
: CMCAMethod
- getScaledFluxCC()
: CMCAMethod
- getScaledFluxCCAnn()
: CMCAMethod
- getScaledResult()
: CSensProblem
- getScaledResultAnnotated()
: CSensProblem
- getScaling()
: CSlider
- getScalingMode()
: CQLayoutMainWindow
- getScanItem()
: CScanProblem
- getScanItemType()
: CScanProblem
- getScanWidget()
: ListViews
- getScore()
: CTableauLine
- getSeconds()
: CCopasiTimeVariable
- getSegmentAt()
: CLCurve
- getSeparator()
: CExperiment
, CReportDefinition
, CTableCell
- getServicesInfo()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getServicesInfoReturn
: ns2__getServicesInfoResponse
- getServicesVersion()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getServicesVersionReturn
: ns2__getServicesVersionResponse
- getSet()
: CRegisteredObjectName
- getSetChild()
: CBitPatternTreeNode
- getSeverity()
: SBMLIncompatibility
- getSibling()
: CCopasiNode< _Data >
- getSingleObjectCN()
: CSensItem
- getSingleObjectDisplayName()
: CSensItem
- getSize()
: CNormalSum
, CGraphNode
, CNormalCall
- getSlider()
: SliderSettingsDialog
- getSliderList()
: SCopasiXMLGUI
- getSliderObject()
: CSlider
- getSliderObjectCN()
: CSlider
- getSliders()
: CCopasiTask
- getSliderType()
: CSlider
- getSliderValue()
: CSlider
- getSolutionValue()
: COptProblem
- getSolutionVariables()
: COptProblem
- getSortKey()
: IndexedNode
- getSpeciesChanges()
: CEFMTask
- getStabilityResolution()
: CSteadyStateMethod
- getStart()
: CLLineSegment
- getStartOfLine()
: CArrow
- getStartValue()
: COptItem
- getState()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
, CModel
, CSteadyStateTask
, CTSSATask
, CTrajectoryTask
- getStateTemplate()
: CModel
- getStaticString()
: CCopasiStaticString
- getStatistics()
: CUnitInterfaceSBML
- getStatus()
: CFunctionAnalyzer::CValue
, CModelEntity
- getStdDeviation()
: CFitProblem
- getSteadyStateStatus()
: CMCAMethod
- getSteadyStateWidget()
: ListViews
- getStepBackwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getStepForwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getStepMatrixColumn()
: CBitPatternTreeNode
- getStepNumber()
: CTrajectoryProblem
, CTSSAProblem
- getStepSize()
: CTSSAProblem
, CTrajectoryProblem
- getStepsPerSecond()
: CQLayoutMainWindow
- getStiffness()
: CEigen
- getStochTimeAndIndex()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
- getStoi()
: CModel
- getStoiReordered()
: CModel
- getStopAction()
: CQPlayerControlWidget
- getStream()
: CReport
- getSubject()
: CRDFNode
- getSubPathIndex()
: CRDFPredicate
- getSubstrateCompartments()
: yyYaccParser
- getSubstrateMulitplicities()
: yyYaccParser
- getSubstrateNames()
: yyYaccParser
- getSubstrates()
: CChemEq
- getSubTask()
: CMCAProblem
- getSubtask()
: CScanProblem
- getSubtaskType()
: COptProblem
- getSubTaskType()
: CSensProblem
- getSubtype()
: CNodeK
- getSubType()
: CCopasiMethod
- getSubWidget()
: CQTSSAResultWidget
- getSums()
: CNormalLcm
- getSymbolicExpExp()
: CUnit
- getSymbolicExponent()
: CUnit
- getSynced()
: CSlider
- getSystemSeed()
: CRandom
- getTable()
: CTSSAMethod
- getTableAddr()
: CReportDefinition
- getTableName()
: CTSSAMethod
- getTarget()
: CReport
- getTargetFunctions()
: CSensProblem
- getTargetKey()
: CEventAssignment
- getTargetObject()
: CEventAssignment
- getTask()
: TaskWidget
- getTaskForFolderId()
: SliderDialog
- getTaskList()
: CCopasiDataModel
, CCopasiXMLParser
, CCopasiDataModel
, CCopasiXML
- getTaskType()
: CReportDefinition
- getTeX()
: CStructureParser
- getText()
: CCopasiMessage
, CQTextDialog
, CQExpressionMmlStackedWidget
, CLTextGlyph
- getTickFactor()
: CSlider
- getTickNumber()
: CSlider
- getTime()
: CDataEntity
, CState
, CModel
- getTimeData()
: CExperiment
- getTimeLimit()
: CCrossSectionProblem
- getTimeSeries()
: CTrajectoryTask
, CTimeSeriesTable
, CTSSATask
- getTimeUnitEnum()
: CModel
- getTimeUnitName()
: CModel
- getTimeUnitsDisplayString()
: CModel
- getTitle()
: CTimeSeries
, CReportDefinition
, CPlotItem
- getTMP1PrintAnn()
: CILDMMethod
- getTMP2PrintAnn()
: CILDMMethod
- getTMP3PrintAnn()
: CILDMMethod
- getTotalNumberOfSteps()
: CScanMethod
- getTotalTime()
: CSimSummaryInfo
- getTotSteps()
: CModel
- getTrajectoryWidget()
: ListViews
- getTransientTime()
: CLyapProblem
- getTransitionTime()
: CMetab
- getTreeSelection()
: CCopasiSimpleSelectionTree
- getTreshold()
: CSparseMatrix
- getTriggerExpression()
: CEvent
- getTriggerExpressionPtr()
: CEvent
- getTriplet()
: CModification
, CBiologicalDescription
, CCreator
, CReference
- getTriplets()
: CRDFGraph
- getTrueExpression()
: CNormalChoice
, CNormalChoiceLogical
, CMathTrigger::CRootFinder
, CNormalChoiceLogical
, CNormalChoice
- getType()
: CCopasiMethod
, CNormalCall
, CNormalLogicalItem
, CCopasiParameter
, CCopasiMessage
, CCopasiTask
, CPlotItem
, CNodeK
, CRDFObject
, CNormalGeneralPower
, ObjectBrowserItem
, CNormalFunction
, CNormalItem
, C2DPlotCurve
, CEvaluationTree
, CCopasiParameterGroup
, CRDFLiteral
, CRDFPredicate
, CFunctionParameter
, CRandom
, CRDFSubject
, CCopasiProblem
, CCopasiParameterGroup
, CEvaluationNode
- getTypes()
: CQSpecieDM
, CQGlobalQuantityDM
, CQCompartmentDM
- getUndefinedFunction()
: CCopasiRootContainer
- getUnits()
: CCopasiContainer
, CCopasiObject
- getUnscaledConcentrationCC()
: CMCAMethod
- getUnscaledConcentrationCCAnn()
: CMCAMethod
- getUnscaledElasticities()
: CMCAMethod
- getUnscaledElasticitiesAnn()
: CMCAMethod
- getUnscaledFluxCC()
: CMCAMethod
- getUnscaledFluxCCAnn()
: CMCAMethod
- getUnsetBitIndexes()
: CStepMatrix
- getUnsetChild()
: CBitPatternTreeNode
- getUpdateMethod()
: COptItem
, CFitItem
, CCopasiObject
- getUpperBound()
: COptItem
- getUpperBoundValue()
: COptItem
- getUptoDateObjects()
: CModel
- getURI()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
, CBiologicalDescription
, CReference
, CRDFPredicate
, CMIRIAMResourceObject
- getURL()
: SBMLReference
- getUsage()
: CFunctionParameter
, CReactionInterface
- getUsedFunctions()
: CFunctionDB
- getUserOrder()
: CStateTemplate
- getValidator()
: CQExpressionWidget
- getValue()
: CCopasiParameterGroup
, CTableCell
, CParameterListItem
, CXMLAttributeList
, CCopasiParameter
, CCopasiParameterGroup
, CCopasiParameter
, CCopasiParameterGroup
, COptions
, CModelEntity
, CFunctionAnalyzer::CValue
, CCopasiParameterGroup
- getValueForRow()
: CQCurrentValueTable
- getValueForSpecies()
: CDataEntity
- getValueObject()
: CCopasiObject
, CCopasiMatrixReference< CType >
, CCopasiVectorReference< CType >
, CMetab
, CModelEntity
, CCopasiObjectReference< CType >
, CCopasiContainer
, CArrayElementReference
- getValuePointer()
: CModelEntity
, CCopasiObjectReference< CType >
, CCopasiParameter
, CCopasiMatrixReference< CType >
, CMetab
, CEvaluationNode
, CCopasiVectorReference< CType >
, CCopasiTimer
, CArrayElementReference
, CCopasiObject
- getValueReference()
: CMoiety
, CModelEntity
- getValues()
: CCompressedColumnFormat
- getVariable()
: CReadConfig
- getVariableGradients()
: COptProblem
- getVariableIndex()
: CEvaluationTree
, CFunction
- getVariables()
: CFunction
, CSensProblem
- getVariableSize()
: COptProblem
- getVariablesPointerList()
: CSensItem
- getVariableStdDeviations()
: CFitProblem
- getVariableValue()
: CFunction
, CEvaluationTree
- getVec_TimeScale()
: CTSSAMethod
- getVector()
: CEvaluationNodeVector
- getVersion()
: CCopasiXML
, CVersion
, CReadConfig
- getVersionDevel()
: CVersion
- getVersionMajor()
: CVersion
- getVersionMinor()
: CVersion
- getVfastSpacePrintAnn()
: CILDMModifiedMethod
, CILDMMethod
- getVolumeRateUnitsDisplayString()
: CModel
- getVolumeUnitEnum()
: CModel
- getVolumeUnitName()
: CModel
- getVolumeUnitsDisplayString()
: CModel
- getVslowMetabPrintAnn()
: CILDMModifiedMethod
, CILDMMethod
- getVslowPrintAnn()
: CILDMModifiedMethod
, CILDMMethod
- getVslowSpacePrintAnn()
: CILDMModifiedMethod
, CILDMMethod
- getWebBrowser()
: CConfigurationFile
- getWeight()
: CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
- getWeightMethod()
: CExperiment
- getWidgetList()
: CScanContainerWidget
- getWidth()
: CLDimensions
, CLGraphicalObject
- getX()
: CLPoint
, CLGraphicalObject
- getY()
: CLGraphicalObject
, CLPoint
- getZeroSet()
: CBitPatternTreeNode
, CStepMatrixColumn
- getZoomFactor()
: CQGLNetworkPainter
- GLOBAL
: CUnitInformation
- global
: CUnitInterfaceSBML::Statistics
- GLOBAL_PARAMETER_INITIAL_VALUES
: CObjectLists
- GLOBAL_PARAMETER_RATES
: CObjectLists
- GLOBAL_PARAMETER_VALUES
: CObjectLists
- GLOBAL_PARAMETERS
: CObjectLists
- GLOBAL_SCALING
: CVisParameters
- globalCheckBoxToggled()
: SliderSettingsDialog
- graphFromXml()
: CRDFParser
- gridLayout
: Ui_FunctionItemWidget
- gridLayout1
: Ui_FunctionItemWidget
- gridLayout2
: Ui_FunctionItemWidget
- GROUP
: CCopasiParameter
- GT
: CEvaluationNodeLogical
, CNormalLogicalItem
- gtims_()
: CTruncatedNewton
- guessColumnNumber()
: CExperiment
, CTableRow
- guessGraphRoot()
: CRDFGraph
- Gui
: CCopasiObject